Кость Маджина

События аниме разворачиваются в Японии начиная с 1990-х годов и охватывают более десяти лет жизни главного героя Такаки Тоно. Повествование разделено на три части, каждая из которых описывает любовные отношения в разные периоды его жизни. Первая часть, "Отрывок о цветущей сакуре", начинается в 1994 году, когда Тоно заканчивает начальные классы школы. Он испытывает симпатию к девочке по имени Акари, но их общение прерывается из-за переезда её семьи. После расставания они продолжают переписываться и иногда встречаться, однако семья Акари часто меняет место жительства, что усложняет их контакты.

Через год Тоно решает признаться Акари в своих чувствах в письме. При встрече между ними происходит первый поцелуй, но письмо теряется, и после этого они расстаются навсегда. Вторая часть, "Космонавт", описывает период средней школы на другом острове. В Тоно влюбляется девочка по имени Канаэ Сумида, но она не решается признаться в своих чувствах и на протяжении нескольких лет терпит неразделённую любовь. В выпускном классе она наконец решается и говорит о своей любви.

Третья часть, "5 сантиметров в секунду", показывает взрослую жизнь Тоно. Он работает и состоит в долгих отношениях с девушкой, но в итоге пара расстаётся. Тоно бросает работу и теряет смысл жизни. Однажды, бродя по окрестностям города, он случайно встречает свою первую любовь - Акари.